灰指甲在中医理论中接近鹅掌风的症状，采用中医治疗的方式有助于缓解症状，可以口服药物或外用中药煎剂浸泡或热敷，但很难除根，因此建议明确后及时就医，在医生指导下选择合适的方式进行改善，避免盲目用药。
可在医生辨证后口服祛风地黄丸、清热地黄丸等中成药治疗，有助于缓解灰指甲的症状。也可由医生组方配伍，使用金银花、连翘、当归、地肤子、赤芍、防风、黄柏等中药煎成汤剂内服，有助于祛风除湿，治疗灰指甲。
还可外用中药煎剂浸泡或热敷患处，常用青黛、苍术、黄柏、白芷、枯矾、地骨皮、等中药组方配伍，具有疏通气血、杀虫止痒的作用，可用于鹅掌风的治疗。
但灰指甲的病因是真菌感染，上述中医治疗的方法难以除根，有可能停止治疗后还会复发。因此还可采用化学药物治疗，主要为特比萘芬、伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药，需在医生指导下足量足疗程地使用，相对来说更容易达到除根的治疗效果。